美格导读｜最新宏转录组学研究进展

浪浪沙

　　活性污泥处理利用微生物吸收和代谢化学物质的能力，在废水处理过程中消除微量有机污染物(TrOCs)方面显示出前景。宏转录组本研究提出了一个全面的工作流程，用于识别和表征复杂微生物群落中涉及TrOCs生物转化途径的关键酶。为证明该工作流程的适用性，研究者研究了铜氧化酶(MCOs)的酶基作为TrOCs生物转化的一个假定相关驱动因素。研究分析了活性污泥的宏转录组数据，包括3个在不同TrOCs氧化电位群落中表达的系统发育不同的mco编码基因。在纯化编码的酶作用下，筛选了它们对不同底物的活性后，发现在介质化合物2,2'-偶氮-双-3-乙基苯噻唑啉-6-磺酸存在时，MCOs对特定的TrOCs具有显著的活性。

　　泥炭藓与蓝藻之间的相互作用在陆地碳氮循环过程中发挥着重要作用。本研究中，研究者使用交叉喂养的方法，通过空间解析代谢谱和宏转录组学来描述Sphagnum和Nostoc cyanobacteria之间的共生关系。pH梯度研究表明，Sphagnum-Nostoc的共生关系是由pH驱动的，只有在较低的pH值下才会发生共生。代谢交叉摄食研究和空间分辨基质辅助激光解吸/电离质谱成像(MALDI-MSI)确定海藻糖是Sphagnum释放的主要碳水化合物来源，而Nostoc与牛磺酸和磺乙酸酯等一起消耗了海藻糖。作为交换，念珠藻增加了嘌呤和氨基酸的分泌。宏转录组分析表明，当与念珠菌共生时，Sphagnum的宿主防御能力将降低，而不仅仅是化学接触的结果。